了解聚糖

令人驚訝的是，一種聚糖似乎是引發(fā)整個(gè)開(kāi)放的原因。

研究生Terra Sztain-Pedone和加州大學(xué)圣地亞哥分校的Rommie Amaro實(shí)驗(yàn)室的同事以及匹茲堡大學(xué)的Lillian Chong的同事，精-確地研究了聚糖如何激活SARS-CoV-2。Sztain-Pedone將于2月25日星期四在生物物理學(xué)會(huì)第65屆年會(huì)上介紹這項(xiàng)研究。

使SARS-CoV-2(引起CO-VID-19的病毒)無(wú)法免疫系統(tǒng)的一件事是，它被稱為聚糖的糖所覆蓋。一旦SARS-CoV-2感染了某人的身體，它就會(huì)被該人*的聚糖所覆蓋，從而使免疫系統(tǒng)難以識(shí)別該病毒，因?yàn)樗枰c之抗?fàn)?。這些聚糖在激活病毒中也起著重要作用。

研究小組使用可并行運(yùn)行許多模擬的高級(jí)高性能計(jì)算算法，研究了隨著SARS-CoV-2尖峰被激活，這些原子中每個(gè)原子的位置如何變化。Sztain-Pedone說(shuō)：“大多數(shù)計(jì)算機(jī)無(wú)法使用半百萬(wàn)個(gè)原子來(lái)完成此任務(wù)。”為了使SARS-CoV-2活化并具有感染力，病毒外部的刺突蛋白需要改變形狀，以使其粘附在我們的細(xì)胞上?？茖W(xué)家們知道，覆蓋這些尖峰的聚糖有助于SARS-CoV-2逃避免疫系統(tǒng)，但尚不清楚它們?cè)诩せ钸^(guò)程中起什么作用。研究這些分子非常棘手，因?yàn)樗鼈兪侨绱酥?，并且有許多部分以微妙的方式運(yùn)動(dòng)。Sztain-Pedone解釋說(shuō)：“在其中一種加標(biāo)蛋白質(zhì)模擬中，有500萬(wàn)個(gè)原子。”

該團(tuán)隊(duì)能夠鑒定出負(fù)責(zé)激活刺突蛋白的聚糖和分子。